培养目标不同；初试科目不同。会计学硕只有全日制一种学习方式，学习期间不允许正式入职。会计专硕的学习方式有全日制和非全日制两种，全日制需要脱产，周一到周五全天在校学习，非全日制是在职学习，有周末班、集中班两种上课方式可自行选择。

培养目标不同：
会计学硕是学历教育，侧重基础教育、素质教育和专业教育，偏重理论知识的学习和研究，重视科研成果，主要培养在各级院校、事业单位及教育机构从事教育、科研工作的高水平专业人才。
会计专硕是职业教育，培养多偏重于实务操作，学习目的是为了解决实际工作中的问题，提升实践操作能力，主要培养能够胜任各大公司、企业、会计事务所等单位会计工作或会计管理工作的务实型专业人才。
初试科目不同：
会计学硕初试考试科目有：政治（满分100分），英语一（满分100分），数学三（满分150分），会计学或管理学（满分150分）。
会计专硕初试考英语二和管理类联考综合。管理综合满分200分，其中数学占75分，逻辑占60分，写作占65分。英语二考试难度介于四、六级之间，满分100分。